ESS Meridian — первый космический корабль монструозных размеров полный криогенных капсул с людьми отправленный на колонизацию далёкого мира. Но проведение на борту, мягко говоря, аморальных медицинских и научных экспериментов привело к тому, что гордость нации превратилась в ад в безвоздушном пространстве. Сошедшие с ума люди пожирают ничего не понимающих только что проснувшихся товарищей, а отвратительные мутанты устраивают охоту на немногочисленных выживших. Именно в этот момент берёт старт повествование второй части шутера. Нам предлагают выбрать одного из 3 персонажей и снова погрузится в этот кошмар. Главный герой был специально превращён в киборга, чтобы дать его создателям шанс на спасение.

Огромный арсенал оружия, более 100 имплантатов с различными эффектами, развитие протагониста, продолжительная сюжетная линия и дополнительные побочные миссии ждут всех кто отважится играть в Dead Effect 2.